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1.溫度
根據三種不同的嗜溫厭氧菌(嗜溫5-20)℃嗜溫20-42℃嗜溫42-75℃）低溫厭氧分為15-20℃)，中溫厭氧(30-40)℃），高溫厭氧(50-60)℃）三種。溫度對于厭氧反應尤為重要。當溫度低于下限溫度時，每下降1℃，效率降低11%。溫度在上述范圍內為1-3℃對厭氧反應的影響不明顯，但溫度變化過大(快速變化)，會降低污泥活力，產生酸積聚等問題。
2.pH值
厭氧水解酸化工藝pH要求范圍松散，即產酸菌PH應控制4-7℃嚴格控制完全厭氧反應pH，即甲烷反應控制范圍6.5-8.0范圍為6.8-7.2，pH低于6.3或高于7.8.甲烷化率降低。
氧化還原電位：氧化還原電位為-100~+100mv，氧化還原電位為-150~-400mv。因此，應控制進水中的氧含量，以免對厭氧反應器產生不利影響。
3.營養物
氧反應池營養物比例為C:N:P=(350-500):5:1。
4.有毒有害物
影響厭氧反應的有害物有三種。
(1)無機物:氨、無機硫化物、鹽、重金屬等。特別是硫酸鹽和硫化物比較嚴重；
(2)有機化合物:含有揮發性脂肪酸的非極性有機化合物(VFA)，非極性酚類化合物、單寧化合物、芬香族氨基酸、焦糖化合物等。
(3)生物異型化合物、氰化物、洗滌劑、抗生素等。
